第一个例子便是德国的蔷薇十字会，其成立于1600年。蔷薇十字会寻求的完全在于整合所有的人类知识，将神秘学与科学融合成一门哲学，然后传授于底下的成员。

蔷薇十字会将学习点归入三本手册，这三本册子分别作于1614年、1615年和1617年，但作者不详，其名曰Fama Fraternitatis Sosae Crucis（著名的蔷薇十字会）、Condessio Fraternitatis Rosae Cruis（蔷薇十字会的声明）、以及The Chemical Wedding of Christian Rosenkreutz（克里斯蒂安·罗森克洛兹的化学婚礼），这些书册说的是克里斯蒂安·罗森克洛兹在1407年创立了神秘学社团。

克里斯蒂安·罗森克洛兹是一名炼金术士，他到过埃及、巴勒斯坦、摩洛哥菲斯，他在哪些地方学习了古老的神秘主义哲学并获得启迪。在The Chemical Wedding中，罗森克洛兹被说成是具有魔力的，他创造了一个人造新娘和一个人造新郎，并通过炼金术中伟大工作的方式使他们结婚、死亡，以及复活。

根据第一本手册的说法，罗森克洛兹的智慧源于古埃及的传统。由于对那里的习俗制度不满，所以便来到了德国并创建了协会来继续传播这一传统。罗森克洛兹于106岁时去世，他被会友埋入坟墓并将协会的秘密一同带了进去，这些秘密直到1604年在他的坟墓重新打开时才得知。根据手册上的描述，罗森克洛兹的坟墓有七间墓室，顶上有一轮太阳。墙壁上布满了魔法符号，墓室中间有一个石头祭坛，当祭坛打开时就会发现罗森克洛兹一直未腐烂的躯体。

虽然这些都是协会在手册上通过图像的描述，但是很多人都认为是真的。为了响应这股热情，蔷薇十字会成立了。总的来说，蔷薇十字会实践的是炼金术，但仅仅只局限于炼金术的精神层面，而非实验室里在物质上的实践。但是他们开创了将精神上的目标与科学结合的尝试。他们在许多方面都提供了一种介于宗教与科学之间的方式，这应该是受到当时的科学名人的影响，如牛顿（1571－1630），不但发明了万有引力理论同时还是一名炼金术士；还有开普勒（1571－1630），提出了行星运动的三大定律，但他同时也是一名占星术士。当时也认为是说成立于1660年的“伦敦皇家协会”——当时世界上第一家科学组织之一——就是效仿蔷薇十字的理念而建立的，致力于在哲学人士群体中共享知识，不过也就是在皇家协会中分成了科学与宗教。 ()

在17世纪，欧洲的宗教同样还是分为天主教和新教两大派。虽然起初新派并不为天主教庭接受，但蔷薇十字会却提供了一种中间的说法，即灵性的追求比宗教派别更重要。蔷薇十字会员们认为，他们的哲学信奉的是自古以来所有古老科学和教派都有表达的数字和几何上的神圣真理。他们相信这种真理都有在古老的建筑名作中呈现，比如埃及金字塔和所罗门神殿。牛顿，举世闻名的科学家，当时也有花了大把的时间对所罗门神殿在精神层面的意义做了研究，发现所罗门神殿就是一种“曼陀罗”（神秘主义者用于冥想的具有暗示性的神秘图形），其代表了精神世界，诉说了创造的过程。到了18世纪，牛顿的研究有了成果，他的这种成果深深影响了其后的一个新的神秘学组织——共济会。

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